С 2000-х годов в структуру университета входят 13 факультетов — исторический, математики и компьютерных технологий, физики и информационно-коммуникационных технологий, биолого-химический, медицинский, юридический, экономический, финансово-экономический, географии и геоэкологии, агротехнологический, иностранных языков, филологический (в 2007 году преобразован в Институт чеченской и общей филологии), государственного управления (с 2005 года). В 2003 году был создан Центр дополнительного профессионального образования, призванный заниматься профессиональной переподготовкой специалистов. В 2006 году он преобразован в факультет дополнительного профессионального образования и повышения квалификации.
В университете функционируют ботанический сад, зоологический музей, историко-краеведческий музей, библиотека с 5 отделами обслуживания.
При помощи регионального общественного фонда имени первого Президента ЧР А.А. Кадырова завершено строительство современного спортивного модуля для организации спортивно-массовой работы среди студентов и сотрудников университета.
Спортивные команды по футболу, волейболу, баскетболу, восточным единоборствам отстаивают честь университета в студенческих спартакиадах.
www.chesu.ru